Dưới thời Việt Nam Cộng hòa, địa bàn huyện Ea Súp hiện nay thuộc quận Buôn Hồ, tỉnh Darlac.

Sau năm 1975, quận Buôn Hồ được chuyển thành huyện Krông Búk.

Ngày 30 tháng 8 năm 1977, Hội đồng Chính phủ ban hành Quyết định 230-CP[1]. Theo đó, tách 6 xã: Ea Pốk, Quảng Phú, Ea H’đinh, Ea Súp, Krông Na, Cư Suê thuộc huyện Krông Búk để thành lập huyện Ea Súp.

Khi mới thành lập, huyện có 6 xã nói trên. Huyện lỵ đặt tại xã Ea Súp.

Ngày 3 tháng 4 năm 1980, thành lập hai xã mới lấy tên là xã Ea Tar và xã Cư M'gar.[2]

Ngày 17 tháng 1 năm 1984, chia xã Ea Súp thành 3 xã: Ea Súp, Ea Bung và Ea Lê.[3]

Ngày 23 tháng 1 năm 1984, Hội đồng Bộ trưởng ban hành Quyết định 15-HĐBT[4]. Theo đó, tách 6 xã: Cư M'gar, Cư Suê, Ea H'đing, Ea Pốk, Ea Tar, Quảng Phú để thành lập huyện Cư M'gar.

Huyện Ea Súp còn lại 4 xã: Ea Bung, Ea Lê, Ea Súp, Krông Na.

Trong giai đoạn 1988-1994, huyện thành lập thêm 3 xã: Ea Huar, Ea Rốk và Ea Wer.

Ngày 21 tháng 1 năm 1995, Chính phủ ban hành Nghị định 08/CP[5]. Theo đó, chuyển 3 xã: Cuôr Knia, Ea Bar, Ea Nuôl thuộc thành phố Buôn Ma Thuột về huyện Ea Súp quản lý.

Sau khi điều chỉnh địa giới hành chính, huyện Ea Súp có 10 xã: Cuôr Knia, Ea Bar, Ea Bung, Ea Huar, Ea Lê, Ea Nuôl, Ea Rốk, Ea Súp, Ea Wer, Krông Na.

Ngày 7 tháng 10 năm 1995, Chính phủ ban hành Nghị định 61-CP[6]. Theo đó:

• Chia xã Ea Bung thành hai xã Ea Bung và Ya Tờ Mốt
• Tách 6 xã: Cuôr Knia, Ea Bar, Ea Huar, Ea Nuôl, Ea Wer, Krông Na để thành lập huyện Buôn Đôn.

Huyện Ea Súp còn lại 5 xã: Ea Bung, Ea Lê, Ea Rốk, Ea Súp, Ea Wer, Ya Tờ Mốt.

Ngày 24 tháng 3 năm 1998, Chính phủ ban hành Nghị định 18/1998/NĐ-CP[7]. Theo đó:

• Thành lập xã Cư Kbang trên cơ sở 8.060 ha diện tích tự nhiên và 2.435 nhân khẩu của xã Ea Lê
• Chia xã Ea Súp thành hai đơn vị hành chính là thị trấn Ea Súp và xã Cư M'Lan
• Thành lập xã Ia Lốp trên cơ sở 46.573 ha diện tích tự nhiên và 2.256 nhân khẩu của xã Ea Rốk.

Ngày 16 tháng 5 năm 2006, Chính phủ ban hành Nghị định 47/2006/NĐ-CP[8]. Theo đó:

• Thành lập xã Ia Jlơi trên cơ sở 27.320 ha diện tích tự nhiên và 5.789 nhân khẩu của xã Ia Lốp
• Thành lập xã Ia Rvê trên cơ sở 11.316 ha diện tích tự nhiên và 1.082 nhân khẩu của xã Ea Bung, 11.398 ha diện tích tự nhiên và 2.201 nhân khẩu của xã Ya Tờ Mốt.

Huyện Ea Súp có 1 thị trấn và 9 xã như hiện nay.